邵晗琪 刘玉琴
主动脉瓣钙化(calcific aortic valve disease, CAVD)是最常见的老年人的瓣膜性心脏病,在中国的发生率不断增加[1]。CAVD患者通常会出现胸闷、疼痛、呼吸困难和晕厥,可能导致充血性心力衰竭和心源性猝死[2]。目前,CAVD唯一可治愈的方法是侵入性治疗,包括外科主动脉瓣置换术和经导管主动脉瓣植入术[3,4]。然而,这种治疗措施存在一定的局限性,如主动脉的血流动力学不能完全恢复,主动脉窦的解剖学结构不能完全重建,且生物人工瓣膜仍然有钙化和成骨的风险。另外,即使成功的侵入性治疗也可能导致严重的心脑血管不良事件,并产生更多的创伤和医疗费用[5]。因此,对CAVD进行早期诊断并提供有效的药物治疗仍是巨大的挑战。
miRNA通过RNA诱导沉默复合体导致mRNA的降解和翻译的抑制,因此miRNA失调可能参与CAVD发生。有研究表明,miRNA参与CAVD的调控过程,如miR-92a可作为急性CAVD的潜在分子标志物,miR-34a可通过抑制Notch1-Runx2信号通路缓解CAVD[6,7]。然而,目前通过多组学的手段对CAVD患者样本进行联合分析的研究较少。
因此,本研究在GEO数据库上收集了CAVD相关的基因表达及miRNA芯片数据,采用更严格的统计分析方法筛选差异基因与miRNA,并进行了miRNA-差异基因的生物信息学联合分析,同时检索了不同病因相关基因的差异表达情况,旨在寻找潜在药物干预靶点,为探究有效的治疗方式提供新思路。
1. 数据收集:以“calcific aortic valve”、“Homo sapiens”为关键词,在GEO数据库(https:∥www.ncbi.nlm.nih.gov/geo/)找到2组转录组测序数据(GSE55492、GSE76718)、1组基因芯片数据(GSE51472)及1组miRNA芯片数据(GSE87885)。GSE55492与GSE76718分别包括10例健康人及9例CAVD患者、8例健康人及9例CAVD患者的主动脉瓣样本。……